Как бюджетному учреждению на ОСНО учесть НДС в расходах при расчете налога на прибыль?

Добрый день!
Уважаемые коллеги помогите ответить на вопрос: бюджетное учреждение на ОСНО большую часть доходов получает по операциям не облагаемым НДС, ввиду больших налоговых рисков НДС к вычету не предъявляет, как при определении расходов по налогу на прибыль правильно вычесть НДС по операциям, облагаемым НДС, ведь иногда точно отнести НДС по облагаемым и необлагаемым операциям практически невозможно (допустим счет за электроэнергию приходит общий, а множество малых подразделений в операциях облагаемых НДС не имеют отдельного счетчика), получается учреждение в 2-м проигрыше?
Всем спасибо.